TRIM55/PDZRN4在胃癌组织表达水平及其在低氧条件下对胃癌调控作用的研究

目的:探索TRIM55/PDZRN4在胃癌细胞和胃癌组织中的表达,分析其异常表达的临床意义。探索与胃癌低氧微环境相关的生物标志物,为胃癌的诊NN2211核磁断和治疗提供一定的理论依据。方法:(1)在细胞实验中,购买正常人胃黏膜上皮细胞株GSE-1和四种不同分化类型的人胃癌细胞株(HGC-27、MKN-45、NCI-N87、KATO-Ⅲ),先进行细胞培养和短串联重复序列(short tandem repeats,STR)分型检测技术鉴定。进一步逆转录荧光定量聚合链式反应(reverse transcription quantitative polymerase chain Staurosporine采购reaction,RT-qPCR)实验和基因测序结果显示TRIM55、PDZRN4基因在不同细胞中的表达水平。(2)利用胃癌细胞株NCI-N87作为研究对象,构建细胞低氧模型。在常氧、低氧(3%O_2)条件培养24h和48h后,RT-qPCR实验显示TRIM55、PDZRN4基因在胃癌细胞中表达变化Critical Care Medicine。(3)使用UALCAN、GEPIA、LOGpc和Kaplan-Meier Plotter等多个在线数据库对TRIM55、PDZRN4在胃癌中的表达差异、生存分析方面进行综合分析。结果:(1)首先通过STR分析验证了各细胞系的质量。TRIM55基因和PDZRN4基因在不同胃癌细胞中表达量均上升。(2)正常培养24h或48h后,胃癌细胞NCI-N87中PDZRN4基因和TRIM55基因表达量均呈上升趋势;低氧培养24 h后,PDZRN4基因和TRIM55基因表达量均高于正常培养组;低氧培养48 h后,PDZRN4基因和TRIM55基因表达量均高于正常培养组,且该趋势具有显著性变化。(3)运用UALCAN数据库及GEPIA数据库分析发现TRIM55、PDZRN4 mRNA在胃癌中表达量低于正常组织。(4)运用UALCAN数据库和Kaplan-meier Plotter数据库分析TRIM55、PDZRN4表达与胃癌患者生存率的关系,发现TRIM55、PDZRN4高表达组胃癌患者总生存期(overall survival,OS)明显低于低表达组;针对PDZRN4,在LOGpc数据库的TCGA、GSE84437和GSE62254数据集中得到进一步证实;另外,在GSE62254数据集中,PDZRN4高表达组胃癌患者无病生存期(disease free survival,DFS)明显低于低表达组。针对TRIM55,在LOGpc数据库的TCGA数据中,TRIM55高表达组胃癌患者无进展间隔期(progression free interval,PFI)明显低于低表达组。检索Kaplan-Meier Plotter数据库发现,TRIM55高表达组胃癌患者再次进展生存期(post progression survival,PPS)明显低于低表达组,PDZRN4高表达组胃癌患者首次进展生存期(first progression survival,FP)和PPS明显低于低表达组,差异有统计学意义。结论:胃癌细胞中TRIM55基因和PDZRN4基因的表达量均上升,而胃癌患者TRIM55和PDZRN4的表达低于健康对照组。TRIM55和PDZRN4可能分别是潜在的具有临床相关性的癌基因和抑癌基因,对胃癌的发生发展过程起到重要作用。生信分析结果显示,在胃癌组织中,TRIM55和PDZRN4高表达与较差的预后相关。细胞实验初步验证表明低氧条件下通过调节胃癌细胞TRIM55、PDZRN4表达而影响其恶性程度,提示TRIM55、PDZRN4有望成为胃癌低氧相关的预后生物标志物和治疗靶点。