目的 分析食管鳞癌组织中表皮生长因子受体（EGFR）、Kirsten鼠类肉瘤病毒癌基因（KRAS）和磷脂酰肌醇3激酶（PIK3CA）基因的突变情况及其与患者临床特征的关系。方法 选取2006年1月至2012年12月在新疆医科大学第一附属医院确诊的210例食管鳞癌患者的组织标本进行DNA提取和目标位点扩增，再利用一代测序的方法对EGFR18号和Komeda diabetes-prone (KDP) rat21号外显子、KRAS2号外显子、PIK3CA9号外显子进行测序，探讨各基因突变情况及其与临床病理特征的关系，并分析不同基因突变之间的相关性。结果 210例食管鳞癌标本中EGFR基因突变率为27.14%,KRAS基因突变率为14.29%,PIK3CA基因突变率为18.59%,EGFR和KRAS双基因联合突变率为4.76%,EGFR和PIK3CA双基因联合突变率为5.71%,EGFR、KRAS、PIK3CA三基因联合突变率为1.43%。Compound 3分子式EGFR基因突变与性别、肿瘤直径、分化程度具有相关性（P<0.05）,KRAS基因突变与肿瘤直径、分化程度、T分期、临床分期具有相关性（P<0.05）,PIK3CA基因突变与性别、肿瘤直径、分化程度具有相关性（P<0.05）,EGFR和PIK3CA联合突变与性别、肿瘤直径、分化程度具有相关性（P<0.05）。Baf-A1EGFR基因突变与KRAS基因突变具有相关性（P<0.05），而EGFR基因突变与PIK3CA基因突变之间无相关性（P>0.05）。结论 食管鳞癌组织中EGFR基因突变率最高，PIK3CA基因突变率次之，KRAS基因突变率最低；EGFR与KRAS或PIK3CA基因突变联合检测具有一定的临床意义。