为了解兔出血症病毒(rabbit hemorrhagic disease virus, RHDV)RdRp基因的遗传稳定性和变异规律，本研究分别克隆了RHDV SCH04株和RHDV2 SCCN03株的RdRp基因，然后对基因序列进行比对和系统发育分析，并通过编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜区域、二级结构、三级结构、磷酸化和糖基化修饰位点的预测，对RdRp进行生物信息学分析。结果显示，两株RdRp基因序列全长均为1 548 bp,编码516个氨基酸。GI.1型RHDV毒株间序列相似性LY2835219分子量为86.9%～99.9%,GI.2型RHDV毒株间为91.3%～99.9%。GI.1型和GI.2型RHDV毒株间序列相似性为84.3%～88.3%。SCH04株和SCCN03株分别属于GI.1a型和GI.2型RHDV,且SCH04株和SCCN03株的RdRp基因核苷酸序列相似性为84.95%,其编码蛋白存在17个氨基酸INCB018424价格差异位点，Medical data recorder氨基酸序列相似性为96.71%;二者均属于稳定蛋白，不存在信号肽和跨膜区域；其分子量、等电点、脂溶系数、平均亲水系数和不稳定系数等指标无显著差异。SCH04株RdRp的α螺旋和β转角比例比SCCN03株略高，分别为41.86%和4.26%,而SCCN03株RdRp的延伸链和无规则卷曲比例比SCH04株略高，分别为12.79%和43.41%;SCCN03株RdRp比SCH04株多4个磷酸化位点和1个N-糖基化位点。分析结果表明不同型间RHDV RdRp基因核苷酸变异率较高，GI.1 RHDV毒株间的变异范围大于GI.2 RHDV毒株。SCH04株和SCCN03株RHDV RdRp的氨基酸序列相似性高于核苷酸序列相似性，其二级结构和高级结构差异较小，遗传相对稳定。本研究为RHDV的遗传演变和生物合成等分子病原学研究提供了科学参考。